L'ALSMT a pour mission exclusive "d'éviter toute altération de la santé des travailleurs du fait de leur travail".
Cette mission générale se décline en quatre axes.
- La conduite d'actions de santé au travail, dans le but de préserver la santé physique et mentale des salariés tout au long de leur parcours professionnel.
- Les conseils dispensés aux employeurs, salariés et représentants du personnel.
- La surveillance de l'état de santé des salariés en fonction des risques concernant leur sécurité et leur santé au travail, de la pénibilité au travail, de leur âge.
- La participation au suivi et à la traçabilité des expositions professionnelles et à la veille sanitaire.